梦幻诛仙手游的副本入口主要分布在京城和特定NPC处，不同等级的副本需通过对应NPC进入。45级副本黑石问情需组队3人以上前往京城(304.192)的梨花班班主处接取任务，60级副本紫藤泣血同样在此接取，但需达到相应等级才开放。副本分为普通和精英两种难度，普通副本每日可完成1次，精英副本每周限1次，奖励更丰厚但难度较高。
60级副本五行天衍和古窟惊魂需通过五行神殿入口进入，前者涉及五行生克机制，后者需注意吸血蝙蝠会优先攻击血量最高角色。普通难度下，古窟惊魂第一关的10只吸血蝙蝠会集火队伍中血量最高成员，建议该角色首回合防御或提前准备复活道具。精英副本如兽神出世则需匹配5人队伍后通过活动界面传送，最终BOSS需三支队伍协作击败。
高等级副本如80级邪神和90级黑龙浩劫需关注动态开启时间。邪神副本允许玩家自选难度，推荐配置1坦克、1治疗和3输出的标准阵容，并携带克制BOSS属性的法宝。90级副本需特别注意阵法搭配，云垂阵可有效克制鸟翔阵的怪物排列，队伍中需至少配备1名封印系职业控制关键怪物。
团队副本如百人副本和10人副本需通过乱葬岗通关后解锁，每日限参与两次。这类副本包含火海逃生、炼金狂人等趣味玩法，最终阶段需多支队伍协同作战。活动期间可在京城公告牌查看具体开启时段，匹配成功后将队伍传送至独立副本空间，建议提前准备元素法宝和复活药品。
副本奖励方面，首次通关必得神兽碎片、高级技能书等珍稀道具，精英副本有概率掉落天琊剑等限定飞行器。每日完成镇妖活动50次、乱世妖魔10次等任务可积累副本参与度，通过诛仙志系统还能解锁隐藏剧情副本。建议优先提升装备品质和宝石等级，合理搭配职业阵容可显著降低副本通关难度。
